理论创新为公有制为主体、多种所有制经济共同发展的基本经济制度的实践探索和完善提供了理论指引。根据中国生产力落后及多层次不平衡的状况，中共十三大作出了中国还处在社会主义初级阶段的科学论断。基于这一论断，明确在社会主义初级阶段不应追求单一公有制，而是要实行公有制为主体、多种所有制经济共同发展的基本经济制度。中共十五大在公有制经济方面形成了新的理论成果，提出“要全面认识公有制经济的含义。公有制经济不仅包括国有经济和集体经济，还包括混合所有制经济中的国有成分和集体成分。公有制的主体地位主要体现在：公有资产在社会总资产中占优势；国有经济控制国民经济命脉，对经济发展起主导作用。这是就全国而言，有的地方、有的产业可以有所差别。公有资产占优势，要有量的优势，更要注重质的提高。国有经济起主导作用，主要体现在控制力上。要从战略上调整国有经济布局。对关系国民经济命脉的重要行业和关键领域，国有经济必须占支配地位。在其他领域，可以通过资产重组和结构调整，以加强重点，提高国有资产的整体质量。只要坚持公有制为主体，国家控制国民经济命脉，国有经济的控制力和竞争力得到增强，在这个前提下，国有经济比重减少一些，不会影响我国的社会主义性质”。形成了“公有制实现形式可以而且应当多样化”和“不能笼统地说股份制是公有还是私有，关键看控股权掌握在谁手中”的理论判断。中共十六届三中全会通过的《中共中央关于完善社会主义市场经济体制若干问题的决定》进一步指出：“要适应经济市场化不断发展的趋势，进一步增强公有制经济的活力，大力发展国有资本、集体资本和非公有资本等参股的混合所有制经济，实现投资主体多元化，使股份制成为公有制的主要实现形式。”这一系列理论创新，丰富了公有制经济的内涵，为公有制经济实现形式的实践探索提供了理论指导。在农村集体经济理论方面，1982年《中共中央批转〈全国农村工作会议纪要〉》将包产到户、包干到户定性为姓“社”而不姓“资”，1983年《中共中央关于印发〈当前农村经济政策的若干问题〉的通知》进一步将包产到户、包干到户提升到“这是在党的领导下我国农民的伟大创造，是马克思主义农业合作化理论在我国实践中的新发展”的新的理论高度，为农村集体经济的改革与发展指明了方向。